Efficient extraction of genomic DNA (gDNA) from biological materials found in harsh environments is the first step for successful forensic DNA profiling. This study aimed to evaluate two methods for DNA recovery from animal tissues (livers, muscles), focusing on the best storage temperature for DNA yield in term of quality, quantity, and integrity for use in several downstream molecular techniques. Six male Swiss albino mice were sacrificed, liver and muscle tissues (n=32) were then harvested and stored for one week in different temperatures, -20C, 4C, 25C and 40C. The conditioned animal tissues were used for DNA extraction by Chelex-100 method or NucleoSpin Blood and Tissue kit. The extracted gDNA was visualized on 1.5% agarose gel electrophoresis to determine the quality of gDNA and analysed spectrophotometrically to determine the DNA concentration and the purity. Both methods, Chelex-100 and NucleoSpin Blood and Tissue kit found to be appropriate for yielding high quantity of gDNA, with the Chelex100 method yielding a greater quantity (P < 0.045) than the kit. At -20C, 4C, and 25C temperatures, the concentration of DNA yield was numerically lower than at 40C. The NucleoSpin Blood and Tissue kit produced a higher (P=0.031) purity product than the Chelex-100 method, particularly for muscle tissues. The Chelex-100 method is cheap, fast, effective, and is a crucial tool for yielding DNA from animal tissues (livers, muscles) exposed to harsh environment with little limitations.
Huda H. Al-Griw, Zena A. Zraba, Salsabiel K. Al-Muntaser, Marwan M. Draid, Aisha M. Zaidi, Refaat M. Tabagh , Mohamed A. Al-Griw(8-2017)

أجريت هذه الدراسة بمدينة طرابلس خلال الفترة ما بين ديسمبر /الكانون 2007 إلى سبتمبر الفاتح 2008 ف لمعرفة مدى إنتشار المصلي لطفيلي المقوسة القندية وبعض الأوليات المعوية التي تصيب القطط وعلاقتها بالجنس والعمر ونظام التربية. تم تجميع (100) عينة دم (مصل) من الوريد الرأسي للقطط لكل من: 51 عينة من الذكور و49 عينة من الإناث باستخدام اختبار التراص السريع Latex agglutination test وذلك للكشف عن الأجسام المضادة لطفيلي المقوسة القندية Toxoplasma gondii وكما تم تجميع وفحص 75 عينة من البرازالقطط بإستخدام طريقة التركيز والترسيب المعتمدة على الفورمالين /الإيثر.أظهرت النتائج أن المعدل العام لإنتشار المصلي لطفيلي المقوسة القندية T.gondii كان 35.0 % (31.37 % في الذكور و38.76 % في الإناث)، لم توجد آية فروق معنوية هامة في الإصابة بين كلا الجنسين (P> 0.05). وكان أعلى معدل لإنتشار المصلي لطفيلي المقوسة القندية في الفئات العمرية الأكثر من 12 شهر، مع وجود فروق معنوية هامة في الإصابة بين الفئات العمرية المختلفة (p < 0.05)، وكان أعلى معدل في القطط السائبة إذ بلغ معدل الإصابة فيها 53.85 %، في حين بلغ معدل الإصابة في القطط المنزلية 22.95 %، وأيضًا وجدت فروق معنوية بين الإصابة ونظام التربيةP< 0.05) ) وأسفرت نتائج الفحص المجهري للبراز بأن نسبة الحالات الموجبة لإنتشار الأوليات المعوية طفيلي: Isospora felis و طفيلي : Isospora rivolta كان 24 (32.0 % ) : ( 14.67 % في الذكور و17.33 % في الإناث ولم توجد آية فروق معنوية هامة في الإصابة بين كلا الجنسين (p >0.05 ) ، وكان أعلى في القطط السائبة (44.8 %) من القطط المنزلية (23.9 %) ( P < 0.05 ).وأظهرت النتائج بأن معظم الأوليات المعوية إنتشار تتمثل في كلا من: طفيلي I.felis(28.0 %) وطفيليI. rivolta (16.0 %) ولم يتم العثور على أي أكياس بيض لطفيلي المقوسة القندية في أي عينة من البراز المفحوصة.ونظرًا لقلة المعلومات الكافية حول ٳنتشار طفيلي المقوسة القندية الأوليات المعوية الأخرى بالقطط، يستحسن متابعة ٳجراء نفس الدراسة في معظم المدن والقرى بليبيا. Abstract This study was conducted in Tripoli –Libya during the period from December 2007 to September 2008 to determine the seroprevalence of Toxoplasma gondii in (household-stray) cats, and the prevalence of the intestinal protozoan parasites in feces with regard to relation between gender, age and rearing system. One hundred blood samples were collected from the cephalic vein of each cat, 51 were males and 49 females, serum was obtained and the latex test was applied to detect antibodies against T.gondii. Seventy– five fecal samples were collected examined by the formaline– ether concentration sedimentation method .The Seroprevalence of T.gondii using the latex was (35%); (31.37%) and (38.76%) were detected in males and females respectively with no significant difference .the seroprevalence of T.gondii was significant (P
نجاة محمد فرج محمود (2010)

الإصابة بالطفيليات المعوية تعتبر إحدى المشاكل الصحية الرئيسية المنتشرة بين الأطفال في العالم ((Quihui-cota et al. 2004. هدف الدراسة الحالية تحديد معدل انتشار مختلف أنواع الطفيليات المعوية ومقارنتها بين طلاب مدارس المرحلة الابتدائية الواقعة ضمن نطاق مدينة طرابلس (منطقة حضرية) ومنطقة الجفارة (منطقة ريفية) , ودراسة تأثير الإصابة علي الصحة العامة لأطفال المدارس. أجريت هذه الدراسة في الفترة من سبتمبر 2005 إلى ابريل 2008. حيث تم جمع البيانات (عينة براز واحدة واستبيان مفصل) من مجموع 3331 طفل (1696 ذكر و1635 أنثي) من 34 مدرسة ابتدائية لمنطقتي طرابلس والجفارة تتراوح أعمارهم من 6 إلى 14 سنة. تم فحص كل العينات(3331) بواسطة طريقة التركيز والترسيب باستخدام الإثر والفرمالين (Garcia, 2001)، وطريقة الفحص المباشر استخدمت لفحص 239 عينة براز طازجة من مجموع العينات (3331)، بعد ذلك يتم فحصهم بطريقة التركيز والترسيب. تم تحضير لطخات براز من راسب 209 عينة من مجموع العينات (3331) وصبغها بصبغة زيل-نلسن المعدلة (Garcia, 2001)، وذلك لتحديد أنواع الطفيليات المعوية البوغية من جنس الكريبتوسبوريدوم. كذلك تم فحص عدد 47 عينة دم لأطفال مصابين بطفيليات معوية و 32 عينة من أطفال غير مصابين (عينات السيطرة) لتحضير لطخات من الدم وصبغها لتعين نوع و نسبة كرات الدم البيضاء وتحديد أشكال كرات الدم الحمراء وعمل اختبار صورة كاملة للدم ((C.B.C. أظهرت النتائج أن نسبة انتشار الطفيليات المعوية في منطقة الدراسة بالكامل كانت (25.1 %), كما أظهرت وجود ثلاثة عشر نوع من الطفيليات المعوية, ثمانية أنواع ممرضة (المتكيسة البشرية, المتحولة الحالة للنسج, الجيارديا اللمبلية, الصفر الخراطيني, السرمية الدويدية, الأسطوانية البرازية, الملقوة العفجية و المحرشفة القزمة), وخمسة أنواع غير ممرضة ( المتحولة القولونية, الوئيدة القزمة, المتحولة الهارتماتية, المتحولة اليودية البوتشيلية و شفوية السياط المنيلية). ولم يثبت وجود طفيل الكريبتوسبوريدوم في(209) عينة من مجموع عينات الدراسة (3331). أظهرت النتائج أن هناك اختلافات معنوية بين نسبة انتشار الطفيليات المعوية في المناطق الحضرية 22.5 %, و المناطق الريفية 27.9, و بين الإصابة بنوع واحد من الطفيليات و الإصابة بأكثر من نوع (P < 0.05). بينما سجل طفيلي السرمية الدويدية و الوئيدة القزمة انتشار أعلي نسبيا في المناطق الحضرية عن المناطق الريفية, بينما كان معدل انتشار باقي الأوليات و الديدان المعوية أعلي نسبيا في المناطق الريفية عن المناطق الحضرية.أشارت نتائج الدراسة إلي وجود اختلافات معنوية في نسبة انتشار الطفيليات المعوية بين المناطق والمدارس في كل منطقة, الإصابة ووجود حيوانات في المنزل أو في المزرعة (P < 0.05), و لم تشر الدراسة إلي وجود علاقة بين الإصابة بالطفيليات المعوية وكلا من الجنس, العمر, الجنسية, وزن الجسم, فصلي الخريف والشتاء, عدد أفراد العائلة, نوع المنزل, مصدر ماء الشرب بالمنزل, مصدر التغذية في المدرسة, طريقة التخلص من مياه الصرف الصحي في المنزل و فقر الدم وزيادة عدد كرات الدم الحمضية (P > 0.05).بينت الدراسة أن الأعراض المصاحبة للإصابة (مثل مغص البطن, فقد الشهية للطعام و الإسهال) شائعة الظهور في الأطفال المصابين بأكثر من نوع واحد من الطفيليات المعوية, بينما يقل ظهور هذه الأعراض في الأطفال المصابين بنوع واحد فقط. كما بينت أن تشخيص الطفيليات المعوية في عينة البراز باستخدام طريقة التركيز والترسيب مع استعمال مثبت (SAF) هي الطريقة المثلي لحفظ وتشخيص كل مراحل وأنواع الطفيليات المحتمل وجودها في عينة البراز. Abstract One of the major health problems among children worldwide is the intestinal parasite infestations (Quihui- cota et al. 2004). The aim of the presented research work was to estimate as well as to compare the prevalence of different intestinal parasitic infection among schoolchildren within different areas in Tripoli city (urban area) and Al- Jfarah area (rural area) and their impact on health of schoolchildren. The study was conducted between September 2005 and April 2008. Data (single stool samples and detailed questionnaire) were collected from 3331 primary schoolchildren (1696 males and 1635 females) from 34 schools of the two areas, the age range between 6 to 14 years. All samples were screened for the presence of non-acid fast parasites by sedimentation concentration method (Garcia, 2001), and direct smear method was used for only fresh stool samples (239/ 3331), followed by sedimentation concentration method. Faecal smears of (209/ 3331) samples were screened by the modified Ziehl-Neelsen method (Garcia, 2001) for detection of Cryptosporidium spp. Blood samples of 47 infected and 32 non-infected (control sample) children for determine C.B.C test and count of eosinophil cells before the initiation of therapy by anti-parasite drugs. Results showed the prevalence rate was (25.1 %), thirteen species of intestinal parasite were detected, and eight species were pathogenic, (Blastocystis hominis, Giardia lamblia, Entamoeba histolytica/ Entamoeba dispar, Ascaris lumbricoides, Enterobus vermicularis, Strongyloides stercoralis, Ancylostoma duodenale and Hymenolepis nana), and five species were non-pathogenic (Entamoeba coli, Endolimax nana, Entamoeba hartmanni, Iodamoeba butschlii and Chilomastix mesnili), no Cryptosporidium spp were detected. Prevalence rate in Al-Jfarah 27 % was higher than that in Tripoli 22.5 %. Prevalence rate of E. vermicularis and E. nana was relatively high in Tripoli than in Al-Jfarah, whereas the prevalence of other intestinal protozoa and helminths was relatively high in Al-Jfarah children than in Tripoli children. The study revealed there was statistically significant in infection rate between districts and schools in each area, single and mixed infections, infection rate and found animals in homes or farms of subjects (P< 0.05), whereas there was no significant relationship between infection rate and sex, age groups, nationality, season, family size, type of house, source of water in home, source of school nutrition, type of sewage disposal in home, parasitic infection and anemia and eosinophilia (P> 0.05). The intestinal symptoms were more common among children by more than one type of intestinal parasites, and the sedimentation concentration method and (SAF) fixatives was a quite reliable for diagnosis and preserved all kinds and stages of parasites found in faecal samples.
نجاة المهدي الغنيمي (2010)